Institute for Clinical Epidemiology and Genomics

Instytut Epidemiologii Klinicznej i Genomiki (Institute for Clinical Epidemiology and Genomics, w skrócie ICEG) jest interdyscyplinarnym ośrodkiem badawczym działającym przy Uniwersytecie Medycznym w Warszawie. Jego głównym celem jest integracja metod epidemiologii klinicznej z nowoczesną genomiką w celu lepszego zrozumienia przyczyn, przebiegu i leczenia chorób o podłożu genetycznym i środowiskowym.

Historia

Instytut został założony w 2002 roku w ramach inicjatywy Ministerstwa Zdrowia oraz Narodowego Centrum Badań Translacyjnych. Pierwszy dyrektor, prof. Jan Kowalski, postawił na szybkie wdrożenie technologii sekwencjonowania nowej generacji (NGS) oraz rozwój baz danych klinicznych o dużej skali.

Misja i cele

• Rozwijanie i wdrażanie metod epidemiologii klinicznej w badaniach populacyjnych.
• Integracja danych genomowych z danymi klinicznymi w celu identyfikacji markerów predykcyjnych oraz nowych celów terapeutycznych.
• Wspieranie translacji wyników badań do praktyki klinicznej, w tym do medycyny spersonalizowanej.
• Szkolenie specjalistów w dziedzinie genomiki, biostatystyki oraz bioinformatyki.

Struktura organizacyjna

Dział	Zakres działalności	Kierownik
Dział Epidemiologii Klinicznej	Badania kohortowe, studia przypadków i kontrolne, analiza czynników ryzyka.	dr hab. Anna Nowak
Dział Genomiki	Sequencjonowanie genomowe, analiza wariantów, rozwój baz danych genetycznych.	prof. Piotr Wiśniewski
Dział Bioinformatyki	Analiza danych wielkoskalowych, rozwój narzędzi informatycznych, wsparcie statystyczne.	dr Katarzyna Szymczak
Dział Współpracy Klinicznej	Koordynacja badań klinicznych, współpraca z szpitalami i przychodniami.	dr hab. Marek Koźlowski

Główne projekty badawcze

1. Polski Konsorcjum Genomiki Chorób Nieuleczalnych (PKGCN) – wieloośrodkowe badanie obejmujące ponad 500 000 uczestników, mające na celu identyfikację genetycznych czynników ryzyka chorób sercowo-naczyniowych.
2. EPIC-Polska – adaptacja międzynarodowego projektu European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition do warunków polskich, ze szczególnym naciskiem na interakcje genetyczno‑środowiskowe.
3. Genomika Onkologii Dziecięcej – sekwencjonowanie nowotworów dziecięcych w celu opracowania spersonalizowanych terapii.
4. Platforma Współdzielenia Danych Klinicznych (PWKD) – rozwój bezpiecznego środowiska do wymiany danych klinicznych pomiędzy ośrodkami medycznymi w Polsce.

Współpraca międzynarodowa

ICEG jest członkiem licznych organizacji międzynarodowych, w tym European Institute of Genomics, International Epidemiology Association oraz Global Consortium for Health Data. Współpracuje z ośrodkami takimi jak Harvard T.H. Chan School of Public Health, Oxford University oraz Karolinska Institute.

Publikacje i osiągnięcia

Od momentu powstania instytut wydał ponad 2000 artykułów w renomowanych czasopismach, m.in. w Nature Genetics, The Lancet oraz International Journal of Epidemiology. W 2021 roku zespół pod kierunkiem prof. Piotra Wiśniewskiego otrzymał nagrodę European Research Council za projekt dotyczący identyfikacji nowych genów związanych z wysokim ciśnieniem krwi.

Infrastruktura

Instytut dysponuje nowoczesnym laboratorium genomiki, w którym znajdują się:

• sekcjoner NGS najnowszej generacji (Illumina NovaSeq),
• systemy do analizy danych wielkoskalowych (klaster HPC),
• laboratorium biochemiczne do badań funkcjonalnych wariantów genetycznych.

Szkolenia i edukacja

Instytut prowadzi coroczne kursy edukacyjne oraz programy doktoranckie w ramach studiów podyplomowych. Dostępne są również stypendia dla młodych naukowców oraz praktyki studenckie w laboratoriach badawczych.

Patrzenie w przyszłość

Do 2030 roku ICEG planuje rozszerzyć biobank do objęcia 1 miliona próbek biologicznych oraz wprowadzić sztuczną inteligencję do predykcji ryzyka chorób na podstawie danych genetycznych i klinicznych.

Linki wewnętrzne

Więcej informacji można znaleźć w następujących artykułach: Epidemiologia kliniczna, Genomika, Medycyna spersonalizowana, Polski Konsorcjum Genomiki Chorób Nieuleczalnych.